在惑星Zi的爱雷米亚沙漠中烟尘弥漫，有一个名叫小邦的少年正以极快的速度向前飞驰。只不过为了一点芝麻蒜皮的小事却被沙漠盗贼一路追赶，最后小邦被盗贼们的蝎型ZOIDS（奇袭毒蝎）逼进了一处被沙漠掩埋已久的遗迹之中。在这座遗迹之中除了早已腐朽了的ZOIDS战斗暴龙和重装长牙狮之外，小邦找不到任何可以帮他脱困的东西……由于奇袭毒蝎接连不断的绵密攻势，遗迹被破坏无遗，就连小邦和战斗暴龙、重装长牙狮也都被崩塌的滚滚黄沙所淹没了！没想到黄沙下的遗迹却另有天地，为了脱困小邦进入遗迹之中找寻可用之物，却偶然的发现了一处密室，在那看似研究所的密室之中小邦发现了一个巨大的椭圆形装置……