云、岩、雾、沙、火五大国的忍者实力彼此均衡，由此保持着和平。不料，最近有四大国发生神秘事件，拥有"血继界限"之力的顶尖忍者接踵失踪。唯一没有出事的火国成了众国猜忌的对象。在重重疑云之中，各国准备开战，眼看第四次忍界大战就要爆发。

火国忍者首领纲手一边布置战力保卫木叶村，一边着手追查真相。

此时，卡卡西突然离开了木叶村。老师为什么突然舍弃了我们？！鸣人十分难过。而卡卡西留下的"铃"似乎蕴藏着某些讯息。前所未有的重任摆在了鸣人面前……